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E situata sulla costa nord del Promontorio del Gargano in prossimita dello sbocco del Canale di Varano uno dei due canale che collegano il Lago di Varano al Mare Adriatico.Foce Varano dista circa 18 miglia marine dalle Isole Tremiti,4 Km da Rodi Garganico,9 Km da San Menaio,15 Km da Carpino,20 Km da Peschici,47 Km da San Severo,80 Km da Foggia,e 220 Km da Bari